Blackwood, Texas: Setelah jatuh melalui lubang di tanah, seorang anak muda terinfeksi oleh alien Hitam Oil. Satu minggu kemudian, di Dallas, gedung federal dibom oleh teroris, menewaskan lima orang, termasuk anak Blackwood. Mulder dan Scully, sekarang bagian dari unit anti-terorisme FBI, belajar bahwa anak serta tiga korban lainnya sudah mati bahkan sebelum pengeboman, penyebab kematian: virus alien. Di gurun Texas, para agen menemukan sebuah kompleks pertanian yang mungkin memegang kunci untuk membuka konspirasi pemerintah seputar makhluk luar angkasa dan virus mematikan mereka yang Mulder dan Scully harus berjuang pemerintah dalam konspirasi dan menemukan kebenaran tentang kolonisasi alien dari Bumi.